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時(shí)間:2022-11-05 15:19:45
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該書具有以下特點(diǎn):①內(nèi)容豐富全面,書中不僅有美容整形的主體內(nèi)容,還涵蓋了人體美學(xué)、美容心理學(xué),并納入了相關(guān)醫(yī)療美容法規(guī)在內(nèi)。②內(nèi)容新穎,對(duì)當(dāng)代前沿學(xué)科的新知識(shí)、新技術(shù),如電腦、超聲、激光、光子、內(nèi)窺鏡、生物材料、納米技術(shù)以及組織工程等在美容整形方面的應(yīng)用作了較詳盡的介紹。③將康復(fù)醫(yī)學(xué)引入美容整形外科,進(jìn)一步提高臨床術(shù)后效果。全書16開,1800頁,397萬字,銅版紙印刷。定價(jià):680.00元(加郵資30元,共計(jì)710,00元)。
聯(lián)系人:重慶市沙坪壩區(qū)高灘巖西南整形美容外科醫(yī)院 胡曉佳
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2007年《中國美容醫(yī)學(xué)》征訂啟事
中國美容醫(yī)學(xué)雜志于1992年6月創(chuàng)刊,是中華人民共和國教育部主管、西安交通大學(xué)和第四軍醫(yī)大學(xué)主辦的國家級(jí)醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)術(shù)期刊,是國家科技部中國科技論文統(tǒng)計(jì)源期刊(中國科技核心期刊)、美國《化學(xué)文摘》、俄羅斯《文摘雜志》和國內(nèi)外多家大型數(shù)據(jù)庫與檢索機(jī)構(gòu)收錄期刊。主要欄目有:基礎(chǔ)研究、整形美容、皮膚美容、頜面美容、齒科美容、眼耳鼻美容、中醫(yī)藥美容、綜述、精品講座、國外美容最新動(dòng)態(tài)、國內(nèi)最新書訊會(huì)訊等。信息量大(136頁)、內(nèi)容涵蓋面寬、圖文并茂、實(shí)用性強(qiáng),是美容醫(yī)學(xué)領(lǐng)域唯一月刊雜志。
《中國美容醫(yī)學(xué)》每期定價(jià)15元,12期,全年共180元(含郵費(fèi)),全國各地郵局均可訂閱,郵發(fā)代號(hào):52-27。2007年的郵局征訂工作現(xiàn)已結(jié)束,但編輯部還可訂閱,聯(lián)系地址:西安市新科路1號(hào)東興科技大廈12層《中國美容醫(yī)學(xué)》編輯部收,郵編:710043。咨詢電話:029-82218513,82251091-8833,網(wǎng)址:http://www.zgmryx.com,E-mail:bianjibu@zgmryx.com,zgmryx@163.com。
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《埋沒導(dǎo)引縫合技術(shù)》出版
《埋沒導(dǎo)引縫合技術(shù)》一書已由廣東科技出版社出版發(fā)行,李森愷教授主持編寫。埋沒導(dǎo)引縫合技術(shù)的核心要求是:從疾病的本質(zhì)出發(fā),以整形外科原則為準(zhǔn)繩,在詳細(xì)掌握局部解剖層次的基礎(chǔ)上.采用隱蔽小切口的潛行分離和埋沒導(dǎo)引縫合技術(shù)手段,實(shí)現(xiàn)微創(chuàng)的組織調(diào)整和組織移植.該書詳盡介紹了整形美容手術(shù)的實(shí)用方法,可以作為一類新手術(shù)方法開拓人們的視野。適合整形、美容、口腔、小兒外科、普通外科等專業(yè)的臨床醫(yī)師和研究生閱讀和參考。對(duì)整形美容外科醫(yī)師的臨床手術(shù)實(shí)踐有實(shí)用性的指導(dǎo)作用。定價(jià):120元,聯(lián)系電話:010-88703924,010-86641047;Email:lisenkai@yahoo,com.cn,frankchina@sohu.com;聯(lián)系人:王永前,李強(qiáng)。
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《國外醫(yī)學(xué)口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè)》刊名變更的聲明
經(jīng)中華人民共和國新聞出版總署批準(zhǔn),《國外醫(yī)學(xué)口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè)》雜志將于2006年第4期起,刊名變更為《國際口腔醫(yī)學(xué)雜志》,新的國內(nèi)統(tǒng)一刊號(hào)為CN51-1698/R。E-mail:gwyxkqyxfc@vip.163.com。
《國外醫(yī)學(xué)口腔醫(yī)學(xué)分冊(cè)》編輯部
社長?總編:辛映繼
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編:朱宏亮
副 主 編:郭樹忠 高天文 祁佐良 李青峰 李薈元 楊壯群
副社長(兼常務(wù)副主編):李慶峰
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中國美容醫(yī)學(xué)雜志社
科研就是探討未知,而求證 未知是人類偉大的稟性,只有人類才有思維和創(chuàng)新。同志曾講過“創(chuàng)新是一個(gè)民族進(jìn) 步的靈魂”。高等學(xué)校就是培養(yǎng)這種靈魂的場(chǎng)所。作為醫(yī)科院校的大學(xué)生應(yīng)及早了解科研、 接觸科研和參與科研,使自己具備新世紀(jì)學(xué)子應(yīng)具備的學(xué)識(shí)和眼光。醫(yī)學(xué)院校開設(shè)醫(yī)學(xué)科研 導(dǎo)論課程,向?qū)W生介紹最新的醫(yī)學(xué)發(fā)展趨勢(shì)、研究進(jìn)展和基本的研究方法,使學(xué)生擴(kuò)大眼界 ,拓寬思路,受到科研思維的教育和啟迪,為以后的醫(yī)學(xué)學(xué)習(xí)和科研以及臨床實(shí)踐打下一定 基礎(chǔ)。筆者從醫(yī)學(xué)科研的定義、方法及醫(yī)學(xué)研究的進(jìn)展幾個(gè)方面來闡述醫(yī)學(xué)院校開設(shè)醫(yī)學(xué)科 研導(dǎo)論的必要性。
1 醫(yī)學(xué)生首先應(yīng)了解醫(yī)學(xué)科研的概念及分類
科學(xué)是知識(shí)和學(xué) 問之意,是在一定社會(huì)環(huán)境中對(duì)知識(shí)的探求,而醫(yī)學(xué)是科學(xué)的分支,是一門古老的科學(xué)。醫(yī) 學(xué)作為一種認(rèn)識(shí)現(xiàn)象,是一種特殊的社會(huì)意識(shí)形式,是關(guān)于人體正常和異常的生命過程以及 同疾病作斗爭(zhēng)和增進(jìn)健康的科學(xué)知識(shí)體系,是人類長期與疾病作斗爭(zhēng)的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)的總結(jié)。醫(yī) 學(xué)研究是一種自然現(xiàn)象,它研究對(duì)象是人,它主要研究人體生命過程及其與外界環(huán)境的相互 關(guān)系規(guī)律,研究人體疾病的發(fā)生、發(fā)展、痊愈及其防治的規(guī)律,研究增進(jìn)人類健康、延長人 類壽命和提高勞動(dòng)能力的有效措施。根據(jù)研究對(duì)象、內(nèi)容和方法的不同,把醫(yī)學(xué)科學(xué)分為基 礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)和預(yù)防醫(yī)學(xué)?;A(chǔ)醫(yī)學(xué)是研究人體的生命活動(dòng)和作用于人體的致病因子、 藥物、毒物以及疾病發(fā)生發(fā)展的本質(zhì)和普遍規(guī)律的科學(xué)體系,是整個(gè)醫(yī)學(xué)發(fā)展的基礎(chǔ)和先導(dǎo) 。臨床醫(yī)學(xué)是研究認(rèn)識(shí)疾病和治療疾病的科學(xué)體系,是醫(yī)學(xué)中的技術(shù)科學(xué)和應(yīng)用科學(xué)的龐大 體系。預(yù)防醫(yī)學(xué)是研究預(yù)防和消除病害、講究衛(wèi)生、增強(qiáng)體質(zhì)、改善和創(chuàng)造有利于健康的生 產(chǎn)環(huán)境和生活條件的科學(xué)體系。以上的分類不是固定不變的,它將隨著醫(yī)學(xué)的發(fā)展而發(fā)展。 傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)分類已經(jīng)不能充分地概括醫(yī)學(xué)領(lǐng)域各分支學(xué)科的現(xiàn)狀和全貌?;A(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī) 學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)三者相對(duì)獨(dú)立的傳統(tǒng)界線會(huì)日益模糊,三者之間相互滲透,漸趨融合,各種新 的學(xué)科分支不斷產(chǎn)生。
2 醫(yī)學(xué)科學(xué)研究促進(jìn)了醫(yī)學(xué)的發(fā)展
隨著社會(huì)的發(fā)展,科學(xué)在社會(huì)中地位越來越重要,醫(yī)學(xué)作為科學(xué)一個(gè)分支也如此。20世紀(jì)以 來,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)以空前的速度向前發(fā)展,為保障人類的生命和健康作出了重大貢獻(xiàn)。未來醫(yī)學(xué) 發(fā)展前景如何?人類將遇到哪些困擾?將采取何種對(duì)策去迎接未來的挑戰(zhàn)。這就需要醫(yī)學(xué)院 校的學(xué)生打下扎實(shí)的科研基礎(chǔ)去面對(duì)。
2.1 近代醫(yī)學(xué)研究的發(fā)展
醫(yī)學(xué)的產(chǎn)生已有4000多年,早在文藝復(fù)興時(shí)代,比利時(shí)醫(yī)生維薩里就明確宣言:“我要以人 體本身上的解剖來闡明人體的構(gòu)造?!彼€認(rèn)為科學(xué)不應(yīng)該盲從,必須從實(shí)際出發(fā),因此不 顧教會(huì)不準(zhǔn)解剖尸體的禁令,夜間從刑場(chǎng)偷回尸體,從事人體解剖的研究。1543年,維薩里 發(fā)表了《人體的構(gòu)造》,奠定了人體解剖學(xué)的基礎(chǔ)。1628年,英國醫(yī)生哈維在活體實(shí)驗(yàn)的直 接觀察的基礎(chǔ)上,發(fā)表了《論動(dòng)物的心臟運(yùn)動(dòng)與血液運(yùn)動(dòng)》,把生理學(xué)確立為科學(xué)。自此人 們由認(rèn)識(shí)人體的結(jié)構(gòu)形態(tài)進(jìn)而認(rèn)識(shí)活體的生理功能,開始了近代醫(yī)學(xué)的新時(shí)代。
18、19世紀(jì),近代醫(yī)學(xué)取得了巨大進(jìn)展,主要標(biāo)志為實(shí)驗(yàn)生理學(xué)的發(fā)展,細(xì)胞病理學(xué)的 建立,科學(xué)的微生物學(xué)說的興起。近代醫(yī)學(xué)研究均以實(shí)驗(yàn)觀察為基礎(chǔ),用實(shí)驗(yàn)中觀察到的事 實(shí)來做結(jié)論。它們的特點(diǎn)為:分門別類,各自孤立的研究,由于分門別類的研究,積累了許 多新的事實(shí),引起了近代醫(yī)學(xué)進(jìn)一步分化。例如比較生理學(xué)、病理生理學(xué)、病理解剖學(xué)、胚 胎學(xué)、微生物學(xué)等,都形成了獨(dú)立的學(xué)科。
2.2 新世紀(jì)當(dāng)代醫(yī)學(xué)研究的發(fā)展
二十世紀(jì)當(dāng)代醫(yī)學(xué)發(fā)展的特點(diǎn)是人們的認(rèn)識(shí)向微觀的深入和宏觀上的擴(kuò)展,自然科學(xué)分科的 進(jìn)一步發(fā)展,互相錯(cuò)綜,形成一個(gè)網(wǎng)絡(luò)式的整體系統(tǒng)。醫(yī)學(xué)科學(xué)也隨著現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)的重大 成就,發(fā)生了巨大的變化,從而形成了新的歷史特點(diǎn)。當(dāng)代醫(yī)學(xué)科學(xué)發(fā)展具有既高度分化又 高度綜合的新特點(diǎn),有力地表明了醫(yī)學(xué)研究既是多樣的,又是統(tǒng)一的。馬克思早就指出了科 學(xué)統(tǒng)一的前景,他說:“自然科學(xué)往后將包括關(guān)于人的科學(xué),正像關(guān)于人的科學(xué)將包括自然 科學(xué)一樣,這將是一門科學(xué)”[1]。
醫(yī)學(xué)的分化趨勢(shì)與整體化趨勢(shì):①新技術(shù)提供現(xiàn)代化研究手段,對(duì)人體和疾病的研究達(dá)到分 子水平,正向量子水平前進(jìn)。這就促進(jìn)了學(xué)科的高度分化,例如,當(dāng)今的遺傳學(xué)就發(fā)展了許 多分支,諸如:毒理遺傳、免疫、生態(tài)、行為遺傳學(xué)等。傳統(tǒng)外科也出現(xiàn)了許多分支,例如 :普外、胸外、腦外、顯微外、移植外、整形外等。②整體化趨勢(shì)主要表現(xiàn)為臨床與基礎(chǔ)的 統(tǒng)一,預(yù)防與臨床、基礎(chǔ)的統(tǒng)一,例如:環(huán)境醫(yī)學(xué)、人體力學(xué),生物材料學(xué)等。大生物學(xué)的 誕生就是當(dāng)代醫(yī)學(xué)高度整體化的重要標(biāo)志,它是把地球上所有以生物為研究對(duì)象或研究材料 的學(xué)科集合起來,對(duì)比它們的特性、相互關(guān)系及其地球環(huán)境對(duì)它們的影響。如地球溫室效應(yīng) 、厄爾尼諾現(xiàn)象等。此外,中西醫(yī)理論上的結(jié)合也變成可能。西方醫(yī)學(xué)的成功是分析方法和 手段的勝利。而它的缺點(diǎn)主要是缺少整體觀與系統(tǒng)論造成的。西醫(yī)向更高層次的發(fā)展,將是 在實(shí)證科學(xué)的基礎(chǔ)上,吸收系統(tǒng)與整體論的觀點(diǎn),走向生命現(xiàn)象的復(fù)雜系統(tǒng)論。這就是生物 模式向“環(huán)境-社會(huì)-心理-生物”模式轉(zhuǎn)變的基礎(chǔ),也為中國傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)與西方現(xiàn)代醫(yī)學(xué)在更 高層次的結(jié)合、創(chuàng)立“統(tǒng)一醫(yī)學(xué)”提供了可能性[2]。
總之,新世紀(jì)的醫(yī)學(xué)科研正向兩極方向高度發(fā)展,一方面向細(xì)胞分子、量子、納米生物學(xué)深 入。另一方面,則向有關(guān)種群生態(tài)及生物圈的研究領(lǐng)域展開。學(xué)生必須從這些醫(yī)學(xué)科研導(dǎo)論 中理解這些前瞻性知識(shí)對(duì)將來醫(yī)學(xué)臨床和科研的重要性,增加對(duì)醫(yī)學(xué)的興趣和作為醫(yī)生的責(zé) 任感。新世紀(jì)醫(yī)學(xué)的任務(wù)將從以防病治病為主逐步轉(zhuǎn)向以維護(hù)和增強(qiáng)健康,提高人的生命質(zhì) 量為主,未來尋求醫(yī)學(xué)服務(wù)的不僅是患者,還有相當(dāng)數(shù)量的正常人。尋醫(yī)問診的不僅是身體 缺欠,更多的是得到生活指導(dǎo)和心理咨詢,醫(yī)生開出的不僅是藥方還有生活處方。
3 研究方法
科學(xué)研究是以研究自然界物質(zhì)運(yùn)動(dòng)規(guī)律為直接目的的,在實(shí)驗(yàn)中,人們可以根據(jù)科學(xué)研究的 目的和要求,借助一些特定的儀器和設(shè)備,造成在研究中某些對(duì)象所需要的特殊條件,控制 某些因素或排除一些不利因素,把要研究的問題進(jìn)行精細(xì)地、反復(fù)地觀察和研究,最后得出 科學(xué)結(jié)論。科學(xué)研究史的無數(shù)事例說明,科學(xué)研究已經(jīng)成為科學(xué)知識(shí)新的源泉。醫(yī)學(xué)院校學(xué) 生需要掌握以下幾方面科研基礎(chǔ)知識(shí)和研究方法。
3.1 醫(yī)學(xué)研究的特點(diǎn)
醫(yī)學(xué)研究是認(rèn)識(shí)疾病,掌握它的發(fā)生和發(fā)展過程,提示健康與疾病的轉(zhuǎn)化規(guī)律。因研究的對(duì) 象為人體本身,故在形態(tài)學(xué)、生理學(xué)具有生物學(xué)屬性外,在語言、思維和社會(huì)生活上又具有 社會(huì)屬性,因此人體現(xiàn)象不能籠統(tǒng)用一般生物學(xué)規(guī)律來解釋。另外,許多醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)和觀察不 允許按研究者的意愿在人體上直接試驗(yàn)。
3.2 掌握醫(yī)學(xué)科研的基本程序
①問題提出:愛因斯坦曾說“提出一個(gè)問題往往比解決一個(gè)問題更為重要,因?yàn)榻?決一個(gè)問題也許是一個(gè)數(shù)學(xué)上或?qū)嶒?yàn)上的技巧。而提出新的問題,新的可能性,從新的角度 看舊問題,卻需要?jiǎng)?chuàng)造性的想象力,而標(biāo)志著科學(xué)的真正進(jìn)步”。可見,提出科學(xué)問題,尤 其是提出概念清晰的難題,更能對(duì)科學(xué)進(jìn)步起到真正的推動(dòng)作用。因此,學(xué)生應(yīng)培養(yǎng)善于觀 察、發(fā)現(xiàn)問題的好習(xí)慣。②假說建立與驗(yàn)證:根據(jù)經(jīng)驗(yàn)和知識(shí),包括文獻(xiàn)、大體分析對(duì)象的 內(nèi)部聯(lián)系,提出對(duì)該問題的可能答案或解釋,這種預(yù)先答案叫假說。進(jìn)行醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)或臨床實(shí) 驗(yàn)均需先提出假說,然后通過實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、觀察、統(tǒng)計(jì)等來對(duì)假說進(jìn)行驗(yàn)證。③結(jié)論與資料解 釋:此為科研中更深刻、更有理論和實(shí)踐意義的部分。對(duì)在實(shí)驗(yàn)和臨床研究過程中收集的大 量資料和數(shù)據(jù)進(jìn)行科學(xué)的整理和處理,也就是對(duì)臨床觀察的素材進(jìn)行科學(xué)加工,對(duì)大量數(shù)據(jù) 資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以便為分析判斷,得出科學(xué)的結(jié)論做好準(zhǔn)備。④形成:醫(yī)學(xué)論 文是醫(yī)學(xué)研究的一個(gè)重要組成部分,完備的醫(yī)學(xué)論文應(yīng)具有學(xué)術(shù)性、科學(xué)性和創(chuàng)新性。
3.3 需掌握科研課題的選定
3.3.1 掌握選題的基本要求 ①要有科學(xué)性:表現(xiàn)為科研設(shè)計(jì)是否嚴(yán)密、合理 ,研究方法是否正確、完善等。②要有創(chuàng)新性:科研忌無意義重復(fù)前人的工作。選題的創(chuàng)新 表現(xiàn)在研究方法、設(shè)計(jì)是否在前人的基礎(chǔ)上有所改進(jìn)、提高和創(chuàng)新。③具體明確:醫(yī)學(xué)研究 的選題必須經(jīng)過嚴(yán)格的核對(duì)、分析,真實(shí)明確地反映客觀存在的事實(shí)。對(duì)題目的選定要明確 ,不能含糊不清。④適當(dāng)實(shí)施手段:慎重考慮本人技術(shù)水平和所在單位的設(shè)備狀況,不能脫 離本人和單位具體情況。
3.3.2 需掌握選題的種類 醫(yī)學(xué)科研選題分為:①調(diào)查研究:流行病學(xué)、衛(wèi)生 學(xué)。②實(shí)驗(yàn)觀察:生理學(xué)、藥理學(xué),需要實(shí)驗(yàn)條件和觀察手段。③資料分析:需要既往的醫(yī) 療衛(wèi)生資料,統(tǒng)計(jì)分析,如死因分析等。④經(jīng)驗(yàn)體會(huì):在自己的研究基礎(chǔ)上著重對(duì)某一問題 進(jìn)行探討??傊?科學(xué)研究是醫(yī)學(xué)工作者的重要工作之一,然而,有關(guān)的科研方法在醫(yī)學(xué)院校教育中較 少涉及,僅在研究生培養(yǎng)過程中作為一般內(nèi)容簡要介紹。因此,許多醫(yī)學(xué)本科生畢業(yè)后不知 怎樣進(jìn)行科學(xué)研究。2000年《中華外科學(xué)雜志》的退稿率為74.49%,退稿稿件中科研方法不 正確者占76.25%[3]。表明在醫(yī)學(xué)科研工作中,科研方法的不合理應(yīng)用已成為一種 普遍現(xiàn)象。要彌補(bǔ)醫(yī)學(xué)工作者的這一缺陷,必須加強(qiáng)在校醫(yī)學(xué)生的醫(yī)學(xué)科研能力的培養(yǎng)。開 設(shè)醫(yī)學(xué)科研導(dǎo)論課程就是其中一個(gè)重要的環(huán)節(jié),應(yīng)引起各類醫(yī)學(xué)院校的重視。
參考文獻(xiàn):
[1] 馬克思,恩格斯全集.經(jīng)濟(jì)學(xué)哲學(xué)手稿[M].1844,42:128.
一項(xiàng)成果引關(guān)注
從計(jì)算機(jī)模擬第一次嘗試介入解決分子生物學(xué)的問題開始算起,至今已經(jīng)有大概三分之一個(gè)世紀(jì)了,學(xué)術(shù)界對(duì)它的濃厚興趣和重視程度依然有增無減。畢竟,生物的復(fù)雜度要遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過單一的自然現(xiàn)象,而用筆來計(jì)算生物學(xué)中的規(guī)律,常常是難以想象的(這也是19世紀(jì)末20世紀(jì)初理論物理和如今“理論生物學(xué)”的顯著區(qū)別之一)。
同時(shí),由于生物系統(tǒng)的復(fù)雜結(jié)構(gòu)及多尺度多物理過程的特點(diǎn),這就決定了數(shù)學(xué)在生物學(xué)中的介入,主要是以數(shù)值計(jì)算和模擬為主。就像現(xiàn)代交通技術(shù)中用攝像頭監(jiān)視記錄大街上忙碌穿梭的車流,然后后臺(tái)用電腦分析龐大的細(xì)節(jié)路況信息一樣,分子模擬也用計(jì)算機(jī)來觀察和分析生命活動(dòng)在極小尺度一原子分子一上的活動(dòng)軌跡。這些眾多的原子、分子就像街道上的車輛。但不同的是生物分子內(nèi)的任意一個(gè)原子都與所有其它原子有相互作用,正是這些相互作用使生物分子形成一個(gè)有機(jī)整體。計(jì)算這些巨大數(shù)目的相互作用是耗費(fèi)計(jì)算機(jī)心力-CPU-的最主要任務(wù)。實(shí)際上,一個(gè)普通分子生物學(xué)問題的模擬研究里的計(jì)算量就可以大得足以讓當(dāng)前國際上最強(qiáng)大的超級(jí)計(jì)算機(jī)也難以承受。這也是計(jì)算機(jī)模擬科學(xué)家們要攻克的一個(gè)難關(guān)。
2010年6月,一項(xiàng)研究成果“自適應(yīng)快速多極矩Poisson-Boltzmann方程求解程序”軟件包(AFMPB)的beta版本。這一工作總結(jié)了盧本卓近年來在生物分子靜電相互作用計(jì)算研究中豐富和發(fā)展了的邊界元方法,并首次實(shí)現(xiàn)了與自適應(yīng)新版快速多極矩的結(jié)合,在單CPU計(jì)算上計(jì)算大分子靜電取得最快的加速效果,這也代表了近年來國際上在邊界元方法計(jì)算PB靜電方面的最新進(jìn)展。
盧本卓介紹這一進(jìn)展和軟件的文章“AFMPB:An Adaptive Fast Multipole Poisson-Boltzmann Solver for Calculating Electrostatics in Biomolecular Systems”刊登在了Computer Physics Communication雜志上。
對(duì)盧本卓及其同事發(fā)展的自適應(yīng)快速多極矩邊界元求解PB方程的一整套方法及其開源軟件程序包AFMPB,分子靜電領(lǐng)域權(quán)威專家、國際計(jì)算科學(xué)與發(fā)現(xiàn)雜志主編、美國西北太平洋國家實(shí)驗(yàn)室Nathan Baker教授在Faculty of 1000 Biology上這樣推薦和點(diǎn)評(píng)他們的工作:“文章描述了一組用于生物分子計(jì)算的激動(dòng)人心的、嶄新的方法和軟件。作者提供了一個(gè)多極矩加速的邊界元方法,對(duì)一大類隱式溶劑的生物分子模擬、包括蛋白一蛋白相互作用、擴(kuò)散結(jié)合、擁擠溶液模擬等顯示出了巨大的前景”。
Faculty of 1000 Biology是一個(gè)生物領(lǐng)域著名的在線科研評(píng)價(jià)系統(tǒng),該機(jī)構(gòu)專家每年對(duì)全球SCI文章總數(shù)不足千分之二的優(yōu)秀精品生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)論文進(jìn)行推薦和點(diǎn)評(píng),并賦予“F1000論文”稱號(hào)向科學(xué)界推薦。
另外,最近瑞典斯德哥爾摩大學(xué)Erik Lindahl教授也在他的“分子動(dòng)力學(xué)模擬算法進(jìn)展”的綜述文章中用了一段話來評(píng)述盧本卓和他的合作者們?cè)谑褂每焖俣鄻O矩方法加速PB求解、改善內(nèi)存需要、及應(yīng)用于大分子的情形,并展望了它在并行化和處理非周期系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)。
對(duì)于這一引起廣泛關(guān)注的成果,盧本卓表示,連續(xù)模型是分子模擬中廣泛采用的用來克服全原子模擬的時(shí)間空間尺度限制的方法,但其模型的準(zhǔn)確性和數(shù)值計(jì)算上的困難也是連續(xù)模型方法長期面臨的一個(gè)挑戰(zhàn),其應(yīng)用范圍受到很大限制。而盧本卓他們?cè)诜肿屿o電、電擴(kuò)散及電彈性等方面的工作為實(shí)現(xiàn)高效有效的連續(xù)模型模擬提供了一系列核心技術(shù)、方法與工具,包括模型建立、有效的數(shù)值計(jì)算方法及其所需的分子網(wǎng)格的產(chǎn)生等,將有力促進(jìn)有關(guān)方法的發(fā)展,拓展其應(yīng)用范圍。
兩個(gè)方向顯前景
科研是艱苦的,艱苦到局外人難以感同身受;科研是孤獨(dú)的,孤獨(dú)到?jīng)]有故事可講。十幾年的科研歲月里,盧本卓就像他研究的那些肉眼看不見的微小的生物分子,在飛速地跳躍和運(yùn)動(dòng)著,唯有在顯微鏡下,才能看到它們有多么美,多么熱烈!
2002年,盧本卓獲得了中國科技大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)的博士學(xué)位,之后于2003年赴美深造,先后在加州大學(xué)圣地亞哥分?;瘜W(xué)與生物化學(xué)系及美國著名的非營利性醫(yī)學(xué)研究所――霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所做博士后研究。
2008年,盧本卓作為“百人計(jì)劃”海外優(yōu)秀人才引進(jìn)到中科院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院工作。除了在生物分子靜電計(jì)算的研究中取得了進(jìn)展,一直從事計(jì)算生物/計(jì)算化學(xué)這一高度交叉的新興學(xué)科研究的他,也正在以下方面取得一些有國際影響的成果:
1、在電擴(kuò)散反應(yīng)的連續(xù)模型、數(shù)值計(jì)算及其應(yīng)用實(shí)踐上取得了一些領(lǐng)先的或探索性的結(jié)果。完全用有限元方法實(shí)現(xiàn)了數(shù)值求解Poisson-Nernst-Planck(PNP)耦合方程組,成為目前國際上建立了用連續(xù)模型實(shí)時(shí)實(shí)形(生物分子)研究分子水平上的電擴(kuò)散反應(yīng)過程的完整工具鏈的少數(shù)小組之一。有關(guān)在J Comput Phys等國際一流雜志上。數(shù)值工作受到put.Phys上的評(píng)論:“這些耦合方程的解對(duì)數(shù)值求解是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)最近盧等人提出一個(gè)有限元/邊界元雜交的方法求解了電擴(kuò)散的PNP方程組?!?/p>
而他所做的關(guān)于有限元求解PNP的工作也受到審稿人的評(píng)價(jià)“文章介紹了鼓舞人心的通過求解PNP方程來模擬分子擴(kuò)散反應(yīng)的方法”,“文章解決的問題在應(yīng)用上是重要的,從數(shù)學(xué)和計(jì)算的角度也是吸引人的”,“數(shù)值計(jì)算令人印象深刻”等。
另外,作為一個(gè)應(yīng)用,盧本卓及其同事將PNP模型用于研究帶電底物濃度對(duì)其擴(kuò)散反應(yīng)動(dòng)力學(xué)的影響,通過精致的計(jì)算方法,預(yù)測(cè)了若干新的物理化學(xué)效應(yīng)。
2、與合作者發(fā)展了用表面求跡法對(duì)生物分子的Gaussian Surface生成表面網(wǎng)格的新方法及其應(yīng)用軟件TMSmesh。據(jù)作者了解,這為該領(lǐng)域能對(duì)百萬原子量級(jí)的生物分子穩(wěn)定生成高質(zhì)量表面網(wǎng)格的唯一軟件,其計(jì)算的病毒分子比通常程序能處理的分子大一個(gè)量級(jí)以上。該工作在一定程度上克服了生物大分子表面產(chǎn)生的一個(gè)瓶頸問題,掃除了生物大分子數(shù)學(xué)模擬中的一個(gè)障礙。
而這項(xiàng)工作的研究價(jià)值和科學(xué)意義就在于,生物大分子的表面網(wǎng)格產(chǎn)生一直是一個(gè)公共難題。分子網(wǎng)格不僅在傳統(tǒng)的分子可視化、化學(xué)信息學(xué)、分子模擬等有重要的作用,而且在近年來興起的分子系統(tǒng)的數(shù)學(xué)模擬中也成為一個(gè)必需的要素。但傳統(tǒng)的分子網(wǎng)格生成方法和工具主要是為可視化和結(jié)構(gòu)計(jì)算服務(wù)的,其質(zhì)量不能滿足數(shù)學(xué)模擬方法,如有限元和邊界元模擬的要求。另外,此前已有的程序在處理大體系的表面和立體網(wǎng)格時(shí)都有困難,這造成了目前對(duì)大分子體系進(jìn)行數(shù)值模擬的一個(gè)瓶頸。這項(xiàng)工作一定程度上掃除了表面網(wǎng)格產(chǎn)生的障礙,同時(shí)為有限元模擬所需的整個(gè)分子立體網(wǎng)格的產(chǎn)生提供了一個(gè)很有希望的基礎(chǔ),這也是他們下一步的工作目標(biāo)。
潛心向?qū)W不放松
如今的盧本卓,正在走著一條教學(xué)科研相結(jié)合的道路。自從踏上了這條道路,他年輕時(shí)候騎車遠(yuǎn)行、登山旅游、揮汗擊球的時(shí)光大多便只能成為記憶了。早上坐一小時(shí)地鐵上班,晚上7點(diǎn)后回家,成了盧本卓每日生活的寫照。矢志不渝,潛心向?qū)W,已屆不惑之年的盧本卓,正在這一個(gè)個(gè)忙碌的日子里,書寫著無怨無悔的人生。
對(duì)于未來,盧本卓表示,計(jì)算將成為研究復(fù)雜生命現(xiàn)象的必需的、最基本的工具和方法之一。生物分子的計(jì)算與模擬研究30年來發(fā)展迅速,然而遠(yuǎn)未臻于成熟,在真實(shí)分子生物過程及藥物設(shè)計(jì)研究上的應(yīng)用和預(yù)測(cè)能力還相當(dāng)有限。尤其是在處理具有多尺度特征的生物過程時(shí)所需要的大量采樣對(duì)計(jì)算提出極高的要求,目前仍然是一個(gè)困難,這大大限制了當(dāng)前計(jì)算生物科學(xué)的可預(yù)測(cè)性。為克服這一困難,國際上展開了大量的研究工作,遍及計(jì)算機(jī)技術(shù)、生物物理模型和計(jì)算模擬方法等方面。
基于這樣的學(xué)術(shù)背景,他本人擬開展的研究項(xiàng)目之一是建立一套完整的“離子通道模擬器”,以解決與之相關(guān)的一系列計(jì)算模擬方法和軟件實(shí)現(xiàn)的問題。
在眾多生物學(xué)問題中,盧本卓及其同事選擇比較有代表性的也極具挑戰(zhàn)性的離子通道來作為研究體系。原因是生物膜上的離子通道是細(xì)胞進(jìn)行新陳代謝與周圍環(huán)境進(jìn)行物質(zhì)交換的重要途徑,其結(jié)構(gòu)和功能正常是維持生命過程的基礎(chǔ),其基因變異和功能障礙與許多疾病的發(fā)生和發(fā)展有關(guān)。作為分子生物學(xué)里最集中的陣地之一,離子通道在生物學(xué)研究里有著不可抗拒的吸引力,因?yàn)樗麄兪恰吧募{米閥門”,就像晶體管控制計(jì)算機(jī)一樣。離子通道的一個(gè)最突出特征是離子通透的選擇性,既一種離子通道通常只允許某種特定的離子或無機(jī)小分子通過。通道內(nèi)包含著擁擠的帶電粒子球、固定的和可移動(dòng)的電荷,以及誘導(dǎo)極化電荷。在原子水平上直接模擬離子通道行為是相當(dāng)困難的,或者就幾乎不可能。在分子生物系統(tǒng)間的時(shí)間、體積和濃度的尺度間隙可分別達(dá)到1012。所有的尺度間隙必須同時(shí)處理,因?yàn)樯镌谝凰查g同時(shí)處理了所有的尺度。